随着生物酶技术的不断发展，利用酶制剂酶解罗非鱼皮提取胶原蛋白肽，不仅可以提高罗非鱼附加值，还不会造成环境污染，也避免了资源浪费的问题，是合理开发利用鱼下脚料获取营养活性物质的重要举措！目前用于酶解罗非鱼皮制取胶原蛋白肽的酶制剂有胰蛋白酶、中性蛋白酶、木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶、碱性蛋白酶、复合蛋白酶等。不同蛋白酶因作用点、位点不同，酶解过程的水解度也不同，所得到的胶原蛋白肽分子量随着酶系都有差异，可见蛋白酶系的选择对酶解罗非鱼皮提高胶原蛋白肽分子量是很重要的。在众多蛋白酶系中，木瓜蛋白酶、碱性蛋白酶以及复合蛋白酶在提取胶原蛋白肽方面用是比较广泛的，但若是以水解度或者分子量来作为衡量依据，碱性蛋白酶的水解程度则更胜一筹。

罗非鱼下脚料中的鱼皮、鱼鳞都可以用来生产鱼胶原蛋白肽，但鱼鳞处理起来工序繁琐，需要脱灰脱钙处理，在鱼胶原蛋白生产过程中多以鱼皮胶原蛋白肽为主。运用木瓜蛋白酶酶解罗非鱼皮制取胶原蛋白肽的工艺过程中，因木瓜蛋白酶是内切蛋白酶，其酶解原理是在酶制剂作用下切断鱼皮胶原蛋白内部的肽键，从而形成短链肽，但被切割后的肽链断裂，会使一部分苦味氨基酸基团暴露，从而导致罗非鱼皮酶解后制备的胶原蛋白肽口感苦。

罗非鱼浑身都是宝，鱼肉鲜美，鱼皮、鱼鳞蛋白质含量高，所以罗非鱼皮常被用来制取胶原蛋白肽，产品广泛应用于功能食品、保健品、高级化妆品等领域。制备罗非鱼皮胶原蛋白肽的传统方法主要有酸法、碱法。酸法和碱法因产品残留有化学成分、产品级别低，污染环境等问题被生物酶法所取代，那么如何运用生物酶法对罗非鱼皮进行酶解呢？不同蛋白酶酶解得到的罗非鱼皮胶原蛋白肽水解度不同，其分子量分布随着酶系有差异，选择最适的蛋白酶系对胶原蛋白肽的分子量分布至关重要。