由于酶制剂成本考虑，工业生产中鱼皮胶原蛋白寡肽制取多以碱性蛋白酶、胰酶、木瓜蛋白酶、风味酶为主要酶制剂。具体的酶解条件为：酶制剂添加量0.2-0.3%、反应温度恒温50-55度、为保证口感及灰分控制，在自然状态下不调整反应PH值酶解4-5小时，水解液经分离纯化后，经冻干后得到胶原蛋白寡肽粉。